Els objectius estructurals del Museu d'Història de Catalunya són:

Col·lecció
Conservar, documentar i exhibir testimonis materials i immaterials que il·lustrin la història de Catalunya.

Recerca
Donar suport a les persones i institucions que tenen entre els seus objectius el desenvolupament de temes de recerca relacionada directament amb la història de Catalunya.

Exhibició
Donar a conèixer els fets històrics i la vida quotidiana de Catalunya -en diferents nivells de lectura, adequat cadascun a cada segment de públic-, mitjançant la mostra permanent, les exposicions temporals i les activitats diverses

Difusió
Estimular l'interès pel coneixement de Catalunya i proporcionar una experiència de qualitat.

Comunicació
Posicionar el museu com a referent bàsic per al coneixement de la història de Catalunya i informar i estimular la visita en aquest sentit.